Колодец-это довольно сложное инженерное сооружение, которое требует постоянного ухода. Если вы заметили, что качество воды упало, и у нее появился  неприятный запах, это может значить, что в воду попало какое-то инородное тело (животное, растение и пр.). Причиной может быть и изменившийся уровень песка. В любом случае, нужно прибегать к чистке колодца.